为了明确福建省高温多雨气候条件下烟-稻轮作系统中地表氮、磷流失情况，在连续3 a定位试验条件下研究了不同施肥措施对烟-稻轮作系统中地表氮、磷流失的影响。研究结果表明，福建省烟-稻轮作系统中氮、磷流失主要集中在上半年（烟季），而且氮、磷流失总量主要受降水量的影响，与产流降雨量呈显著或极显著相关关系。当地习惯施肥条件下，烟-稻轮作系统中氮、磷的流失量分别为4.71～14.86 kg·hm-2·a-1和0.93～2.20 kg·hm-2·a-1，流失系数分别为0.76%～1.27%和0.47%～1.71%。与习惯施肥相比，优化施肥处理氮、磷的流失量分别减少了1.25%～13.82%和8.82%～14.99%,流失系数分别为0.76%～1.43%和0.41%～1.54%。增施50%氮肥和增施50%磷肥的氮和磷流失量分别比优化施肥处理提高7.6%～37.6%和21.5%～27.4%。此外，同等施肥量条件下，稻草还田的氮、磷流失量分别提高6.4%～16.4%和-3.4%～14.0%，流失系数分别达到0.86%～1.91%和0.36%～2.00%。综上所述，优化施肥处理可以减少氮、磷的流失量，而增量施肥明显增加肥料流失量，稻草还田也提高了氮、磷流失的风险。