以太湖水华蓝藻中提取纯化的微囊藻毒素（microcystins, MCs）作为微生物生长的碳源和氮源，从富营养化的太湖水体中分离筛选到MCs高效降解菌群JSM004，24 h内可以将初始浓度分别为3.64和 2.62 mg·L-1的MC-RR和MC-LR完全降解。在研究关于环境因子对JSM004降解效率的影响中，发现菌群JSM004的生长受温度和pH值影响较大，而且其对MCs的降解效率也随之变化。结果表明，在接近实际水体的中性和弱碱性环境中，JSM004对MCs的降解活性最强，加入不同含碳和含氮化合物能够促进混合微生物菌群的生长，但是对MCs的降解却有明显的延滞作用。与对照组相比，MCs被完全降解的时间至少推迟24 h。在实验室条件下，JSM004可在72 h内完全降解太湖水中高浓度的MCs。研究结果表明微囊藻毒素降解菌群JSM004具有良好的MCs降解效果，有实际应用前景。