2. 四川省兰月科技有限公司, 成都 610207
2. Sichuan Lanyue Science and Technology Co., Ltd., Chengdu 610207, China
我国是农业大国,畜牧养殖业废弃物产生量巨大,若处理不当,其中的抗生素、重金属等有害元素会通过雨水淋溶、地下水扩散等作用,加重周边地区污染。据报道,畜牧养殖业可增加周边地区铜、锌、镉等重金属污染[1-2],且每年用于畜牧养殖业的抗生素超过8000 t[3]。抗生素大部分为水溶性,使用后不能完全被动物吸收利用,约30%~90%的抗生素通过粪便和尿液排出[2],造成了很多负面效应,如:通过动物残留、作物吸收后进入食物链,在人体内蓄积,达到一定浓度后,造成急性或慢性中毒,导致恶心呕吐、过敏反应、激素分泌异常等,甚至对人体肝肾、淋巴细胞等造成伤害,影响人体健康[5-6];危害作物生长,对植物胚轴、根系、叶子的生长均有不同程度的抑制作用[7-8];影响环境微生态,降低微生物多样性和活性,产生耐药基因[9-12],可能导致含多重耐药基因的超级细菌产生,带来更严重的深远影响。
据报道,在畜牧养殖业废水、粪便和周边土壤中检出浓度最高的抗生素为四环素、喹诺酮类、磺胺类兽药抗生素,其浓度达到了μg·L-1或mg·L-1级别[13-16]。这三类抗生素在土壤中都具有易吸附、难降解的共同特点[17-19],而微生物降解又是大部分抗生素在固相环境中降解的重要途径[20-21],但目前针对这些残留抗生素的微生物降解菌株的筛选研究,局限于单一类型抗生素[22-24],且筛选的菌株大多为细菌,在筛选和应用过程中,会导致某些敏感细菌群和抗生素抗性基因的形成和相互传递[25-26],使得某些致病菌变成多种抗生素耐药菌,造成不可估量的隐形环境污染。因此,本研究以目前畜牧养殖常用的3种抗生素——土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶为靶标物,为减少这3种抗生素抗性因子的传递,筛选鉴定出具有这3种抗生素降解能力的真菌,旨在为防治多种抗生素交叉污染、减少多重耐药基因产生和生产绿色安全农产品提供理论支持。
1 材料与方法 1.1 试验材料 1.1.1 仪器高效液相色谱仪LC-20A,配有紫外检测器(UV)和二极管阵列检测器(DAD),由日本Shimadzu公司制造;高速离心机由德国Eppendorf公司制造;PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统由德国Analytikjena公司制造,紫外分光光度计由北京恒通公司制造。
1.1.2 样品采集采集四川省什邡双盛镇矿厂周边7个重金属污染土壤,重金属镉、锌、铜、铅含量均超过土壤环境质量标准三级上限。采集样品用无菌袋封装,-20 ℃保存备用。
1.1.3 培养基无机盐培养基:(NH4)2SO4 2.0 g,K2HPO4 0.5 g,NaH2PO4 0.5 g,双蒸水(ddH2O)1 L,pH 7.0~7.4,1×105 Pa灭菌30 min。
驯化及筛选培养基:在灭菌后的培养基中,分别加入适量过滤除菌抗生素母液。
分离纯化培养基:马铃薯蔗糖培养基。
1.2 菌株富集驯化培养称量10 g用四分法处理后的样品,分别以土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶浓度100 μg·mL-1为起点,每100 μg·mL-1为一个梯度,接种量为10%,7 d为一个周期,逐级增加抗生素浓度,进行富集驯化培养,培养温度30 ℃,转速150 r·min-1。
1.3 菌株分离与纯化吸取10 mL菌株富集驯化液,加入装有90 mL无菌水和适量玻璃珠的三角瓶中,150 r·min-1充分振荡20 min作为母液菌悬液,进行常规梯度浓度稀释涂布,30 ℃培养3~7 d,将不同形态菌落挑出,进行分离纯化培养。
1.4 菌株降解抗生素能力测定 1.4.1 菌株培养将分离纯化后的菌株斜面培养后,用无菌水将孢子洗脱下来,配制成1×107 cfu·mL-1的菌悬液,按10%接种量,接种到分别含有50、1500 μg·mL-1土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶的无机盐筛选培养基中,每个重复3次,于30 ℃、150 r·min-1振荡避光培养,为消除理化因素的影响,以含有相同浓度抗生素的培养液作为空白对照。菌株培养7 d后,检测发酵物中各抗生素含量,与空白对照相比计算降解率;取50 μg·mL-1抗生素处理等体积培养物,用真空抽滤分离菌丝体,于60 ℃烘干至恒质量,计算生物量。
1.4.2 抗生素浓度测定运用高效液相色谱法及紫外分光光度法进行3种抗生素含量测定。
样品预处理:为排除菌丝吸附抗生素对检测结果的影响,发酵物经超声破碎后,添加提取物进行纯化、洗脱、流动相溶解,供高效液相色谱法测定,其中,磺胺二甲嘧啶纯化工艺参见文献[27];诺氟沙星纯化工艺参见文献[28];土霉素纯化工艺参见文献[29]。
高效液相色谱进样条件:(1)磺胺二甲嘧啶进样条件为C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,粒径5 μm),预柱YMG C18,柱温22 ℃,流动相为25%乙腈:水=1:3,流速1.0 mL·min-1,进样量20 μL,检测波长270 nm;(2)诺氟沙星进样条件为C18色谱柱(150 mm×4.6 mm,粒径5 μm),预柱Kromasil C18,柱温22 ℃,流动相为35%甲醇:水=1:3,流速0.8 mL·min-1,进样量20 μL,检测波长278 nm;(3)诺氟沙星进样条件为C18色谱柱(150 mm×4.6 mm,粒径5 μm),预柱Kromasil C18,柱温22 ℃,流动相为35%甲醇:水=1:3,流速0.8 mL·min-1,进样量20 μL,检测波长350 nm。
土霉素紫外分光光度法检测条件参照文献[30],诺氟沙星紫外分光光度法检测条件参照文献[31],磺胺二甲嘧啶紫外分光光度法检测条件参照文献[32]。
1.5 菌株分类鉴定 1.5.1 菌株形态特征观察对分离得到的菌株用PDA平板30 ℃培养7 d后,采用光学显微镜对菌落、菌丝和孢子等结构进行观察,并参照文献[33]进行鉴定。
1.5.2 ITS核苷酸序列扩增及测定(1) 基因组DNA提取。液氮研磨法破壁后,取大约100 mg研磨物转自1.5 mL离心管中,用真菌基因组提取试剂盒进行菌株基因组DNA提取。(2)PCR扩增。ITS序列使用ITS1(5′ -TCCGTAGGTGAACCT⁃ GCGG-3′)和ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC- 3′)引物进行扩增[34]。反应体系25 μL:10 × Buffer(Mg2+ free)2.5 μL,2.5 mmol · L-1 dNTPs 2.0 μL,25 mmol·L-1 MgCl2 1.5 μL,10 μmol·L-1 ITS1和ITS4各1.0 μL,5 U·μL-1 Taq酶0.3 μL,模板1.0 μL,ddH2O 15.7 μL。扩增反应条件:95 ℃ 5 min,94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共30个循环;72 ℃ 10 min。(3)菌株鉴定。扩增产物送生工生物工程(上海)股份有限公司进行测序,然后在GenBank中进行BLAST比对分析,并用MEGA 6.06软件Neighbor-Joining(NJ)法构建系统发育树。
2 结果与分析 2.1 3种抗生素降解真菌的筛选结果从采集的样品土样中,通过富集驯化,初筛得到30个具有土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶中一种抗生素降解能力的真菌分离物。将初筛获得的真菌分离物进行复筛,结果(表 1)表明,4株真菌分离物具有土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶中至少2种抗生素降解能力。并且,在各抗生素低浓度(50 μg·mL-1)和高浓度(1500 μg·mL-1)含量下,都具有一定的抗生素降解能力,随着抗生素浓度的增加,菌株对抗生素降解能力有不同程度的削弱。在抗生素浓度1500 μg· mL-1条件下,菌株KS256具3种抗生素降解能力,与其他菌株相比其降解磺胺二甲嘧啶能力最强,降解率达到18.53%(与CK相比)。菌株KS272具两种抗生素降解能力,与其他菌株相比其降解土霉素及诺氟沙星能力最强,土霉素降解率达到40.29%、诺氟沙星降解率达到10.59%。各抗生素回收率通过加标法测定,加标样品为空白培养基及菌株各抗生素发酵液,测得回收率结果为91%~96%(表 2),每个样品3个重复,平行实验结果确定了方法的可靠性。
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表 1 具抗生素降解功能的菌株 Table 1 Strains with antibiotic degradation functions |
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表 2 土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶高效液相色谱法回收率 Table 2 Oxytetracycline, norfloxacin, sulfadiazine HPLC recovery rates |
抗生素降解真菌KS248在PDA平板上28 ℃培养6 d形成圆形菌斑,菌落直径3.5~4.5 cm,菌落蛛网状,气生菌丝羊毛状,白色,菌落背面呈牵牛紫;KS256在PDA平板上28 ℃培养6 d形成圆形菌斑,菌落直径2.8~4.9 cm,菌落平铺,气生菌丝羊绒状,白色,基物表面肉色,基物不变色;KS257在PDA平板上28 ℃培养6 d形成圆形菌斑,菌落直径3~4 cm,质地疏松,初白色、黄色,后变为褐色至淡绿色,背面无色;KS272在PDA平板上28 ℃培养6 d形成绒絮状菌斑,菌落表面榄灰色产孢层,菌落背面呈黄色(图 1)。菌株显微特征见图 2。
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A:KS248菌株正面;B:KS248菌株背面;C:KS256菌株正面;D:KS256菌株背面;E:KS257菌株正面;F:KS257菌株背面;G:KS272菌株正面;H:KS272菌株背面 A:The face of colony of strain KS248;B:The reverse side of colony of strain KS248;C:The face of colony of strain KS256; D:The reverse side of colony of strain KS256;E:The face of colony of strain KS257;F:The reverse side of colony of strain KS257; G:The face of colony of strain KS272;H:The reverse side of colony of strain KS272 图 1 真菌在PDA平板上的菌落形态 Figure 1 Colony characteristics of fungi on PDA |
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图 2 菌株KS248、KS256、KS257、KS272的显微镜照片(×400,棉兰染色) Figure 2 The morphology of the strain KS248, KS256, KS257 and KS272(×400, cotton blue staing) |
对4个菌株进行DNA提取、PCR扩增,得到的序列提交GenBank中进行BLAST,下载相似度较高的序列,用MEGA 6.06软件邻接法构建系统发育树(图 3)。如图 3所示,KS272与微紫青霉Penicillium janthinellum(KM268714)在同一分支上,相似性为99%;KS257与聚多曲霉Aspergillus sydowii(LT745389)在同一分支上,相似性为99%;KS256与腐皮镰刀菌Fusarium solani(JN222393)在同一分支上,相似性为99%;KS248与轮状镰刀菌Fusarium verticillioides(KC752592)在同一分支上,相似性为99%
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图 3 4株菌株rDNA-ITS序列N-J系统发育 Figure 3 Neighbor-Joining phylogenetic tree constructed from rDNA-ITS sequence of four strains |
结合菌株形态学特征,菌株KS272鉴定为微紫青霉Penicillium janthinellum(GeneBank Accession:MH045736);菌株KS257为聚多曲霉Aspergillus sydowii(GeneBank Accession:MH045735);菌株KS256为腐皮镰刀菌Fusarium solani(GeneBank Accession:MH045734);菌株KS248为轮状镰刀菌Fusarium verticillioides(GeneBank Accession:MH045733)。
3 讨论我国畜牧养殖规模小、较分散及多种抗生素使用,造成了畜禽抗生素污染物具有抗生素种类多、分布广、易累积扩散、环境生态风险大的特点。目前,国内外针对畜禽常用的土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶这3种抗生素物质造成的污染,筛选微生物降解菌进行治理,土霉素降解菌的研究较多,磺胺二甲嘧啶降解菌和诺氟沙星降解菌研究较少,且多数是针对低浓度抗生素的降解筛选,除少量降解土霉素的真菌外[22, 35],其他降解菌多为细菌类降解菌[36-39]。但在现实的土壤环境,抗生素污染均为多种抗生素交叉污染,它们对环境的生态毒性相互叠加并互补,更加重了对土壤植物、土壤动物、土壤微生物的生态毒性,也加快了土壤环境微生物抗药性发展[40-41]。而抗生素和某些重金属污染物,能共同作用形成复合污染物,对生态环境造成影响[42],重金属也可能降低抗生素的降解速率[43],且这3种抗生素都为广谱性细菌和部分放线菌抑制剂[44],如若筛选细菌作为这三类抗生素降解菌,会增加高抗药性基因产生概率,从而增加菌株使用的生态风险。因此,针对土壤多重高浓度抗生素治理,可减少多种抗生素生态毒性叠加,同时减少抗生素-重金属复合污染物的形成,杜绝多种抗性基因及超级细菌的形成和传播。本研究选取了3种使用量较大的畜牧用抗生素为研究对象,综合考虑到抗生素污染的多样性、菌株使用的普适性、菌株对环境的生态友好性及极端环境的适应性,选取重金属污染土壤进行采样,对多种抗生素污染联合修复微生物的筛选进行了探索,在土霉素、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶初始浓度为50 μg·mL-1和1500 μg·mL-1的条件下,筛选到4株具有多种抗生素降解功能的真菌。这对畜禽粪便累积区多种抗生素交叉污染治理,抗生素-重金属复合污染物的防治具有较强的现实意义,今后还应对抗生素降解菌的使用进行环境生态评估,真正实现抗生素无害化处理。
4 结论(1) 在抗生素-重金属复合污染土壤中,对3种农用抗生素微生物修复种质资源进行了筛选,选育到4株抗生素降解真菌,均具有至少2种抗生素降解能力。
(2) 菌株对3种抗生素降解率从高到低依次排序为土霉素>诺氟沙星>磺胺二甲嘧啶,这可能与抗生素自身结构有关。
(3) 为使所筛菌株的应用具有普适性,测定了菌株在低、高浓度抗生素情况下对抗生素的降解率,随着抗生素浓度增加,菌株对不同抗生素降解能力有不同程度的削弱。
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